Huslejen reguleres ned til 25 pct., når laboratoriet/særindrettet bygning er fuldt ud afskrevet (efter 15 år). Ved reinvestering i laboratorier/særindrettede bygninger ændres huslejegrundlaget til reinvesteringens størrelse. Ved en reinvestering kan huslejegrundlaget maksimalt reguleres ned til 25 pct. af det gældende huslejegrundlag. Afskrivningerne er bevillingsfinansierede og påvirker ikke huslejeniveauet.
Til at afhjælpe et behov for at gennemføre større vedligeholdelsesarbejder og bygningsfornyelse afsættes årligt 150 mio.kr., som administreres af Bygningsstyrelsen. Bygningsstyrelsen udfører også disse arbejder.
Universiteterne kan gennemføre egne indvendige vedligeholdelsesarbejder eller ombygninger inden for en samlet økonomisk ramme på maksimalt 60 mio.kr. pr. projekt, som samtidig er grænsen for aktstykke og orientering af Folketinget. Indenfor aktstykkegrænsen på 60 mio.kr. kan maksimalt 15 mio.kr. pr. projekt udgøres af værdiforøgende arbejder. Det kan eksempelvis være ombygning af et laboratorium i forbindelse med universitetets egne indvendige ombygninger eller det kan være ombygning af et laboratorium på grund af ændrede forskningsprioriteringer. Universiteterne forelægger projekterne for Bygningsstyrelsen for at afklare reetableringspligt.